Protein–RNA interactions for Protein: P11087

Col1a1, Collagen alpha-1(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a1P11087 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col1a1P11087 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col1a1P11087 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col1a1P11087 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col1a1P11087 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col1a1P11087 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col1a1P11087 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col1a1P11087 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col1a1P11087 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col1a1P11087 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col1a1P11087 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Col1a1P11087 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col1a1P11087 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col1a1P11087 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col1a1P11087 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col1a1P11087 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col1a1P11087 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col1a1P11087 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Col1a1P11087 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col1a1P11087 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col1a1P11087 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col1a1P11087 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col1a1P11087 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col1a1P11087 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col1a1P11087 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col1a1P11087 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col1a1P11087 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col1a1P11087 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col1a1P11087 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col1a1P11087 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col1a1P11087 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Col1a1P11087 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col1a1P11087 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col1a1P11087 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col1a1P11087 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col1a1P11087 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col1a1P11087 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col1a1P11087 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col1a1P11087 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col1a1P11087 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col1a1P11087 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col1a1P11087 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Col1a1P11087 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col1a1P11087 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col1a1P11087 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col1a1P11087 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col1a1P11087 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col1a1P11087 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col1a1P11087 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col1a1P11087 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col1a1P11087 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col1a1P11087 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col1a1P11087 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col1a1P11087 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col1a1P11087 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col1a1P11087 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col1a1P11087 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col1a1P11087 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Col1a1P11087 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col1a1P11087 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col1a1P11087 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col1a1P11087 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col1a1P11087 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col1a1P11087 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col1a1P11087 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col1a1P11087 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col1a1P11087 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col1a1P11087 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col1a1P11087 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col1a1P11087 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col1a1P11087 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Col1a1P11087 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Col1a1P11087 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Col1a1P11087 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Col1a1P11087 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Col1a1P11087 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Col1a1P11087 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Col1a1P11087 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col1a1P11087 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col1a1P11087 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col1a1P11087 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col1a1P11087 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Col1a1P11087 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col1a1P11087 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Col1a1P11087 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col1a1P11087 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col1a1P11087 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col1a1P11087 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col1a1P11087 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col1a1P11087 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col1a1P11087 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col1a1P11087 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col1a1P11087 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col1a1P11087 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Col1a1P11087 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col1a1P11087 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col1a1P11087 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col1a1P11087 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col1a1P11087 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col1a1P11087 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms