Protein–RNA interactions for Protein: P10605

Ctsb, Cathepsin B, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsbP10605 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CtsbP10605 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtsbP10605 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtsbP10605 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtsbP10605 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtsbP10605 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtsbP10605 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtsbP10605 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtsbP10605 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtsbP10605 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtsbP10605 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CtsbP10605 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CtsbP10605 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtsbP10605 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtsbP10605 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtsbP10605 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtsbP10605 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtsbP10605 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtsbP10605 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtsbP10605 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CtsbP10605 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtsbP10605 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtsbP10605 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtsbP10605 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtsbP10605 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtsbP10605 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CtsbP10605 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtsbP10605 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CtsbP10605 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtsbP10605 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtsbP10605 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CtsbP10605 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CtsbP10605 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CtsbP10605 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsbP10605 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsbP10605 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsbP10605 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsbP10605 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsbP10605 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsbP10605 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsbP10605 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsbP10605 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsbP10605 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsbP10605 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsbP10605 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsbP10605 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtsbP10605 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtsbP10605 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtsbP10605 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtsbP10605 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtsbP10605 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtsbP10605 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtsbP10605 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtsbP10605 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtsbP10605 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CtsbP10605 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CtsbP10605 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtsbP10605 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CtsbP10605 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtsbP10605 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtsbP10605 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtsbP10605 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtsbP10605 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtsbP10605 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtsbP10605 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtsbP10605 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtsbP10605 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtsbP10605 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtsbP10605 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtsbP10605 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtsbP10605 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtsbP10605 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtsbP10605 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtsbP10605 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtsbP10605 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CtsbP10605 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtsbP10605 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CtsbP10605 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtsbP10605 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtsbP10605 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtsbP10605 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtsbP10605 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtsbP10605 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtsbP10605 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CtsbP10605 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtsbP10605 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtsbP10605 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtsbP10605 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtsbP10605 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtsbP10605 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtsbP10605 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtsbP10605 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtsbP10605 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtsbP10605 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtsbP10605 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CtsbP10605 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CtsbP10605 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CtsbP10605 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CtsbP10605 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CtsbP10605 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms