Protein–RNA interactions for Protein: P10493

Nid1, Nidogen-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid1P10493 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nid1P10493 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nid1P10493 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nid1P10493 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nid1P10493 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nid1P10493 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nid1P10493 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nid1P10493 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nid1P10493 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nid1P10493 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nid1P10493 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nid1P10493 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nid1P10493 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nid1P10493 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nid1P10493 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nid1P10493 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nid1P10493 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nid1P10493 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nid1P10493 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nid1P10493 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nid1P10493 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nid1P10493 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nid1P10493 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nid1P10493 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nid1P10493 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nid1P10493 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nid1P10493 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nid1P10493 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nid1P10493 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nid1P10493 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nid1P10493 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nid1P10493 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nid1P10493 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nid1P10493 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nid1P10493 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nid1P10493 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nid1P10493 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nid1P10493 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nid1P10493 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nid1P10493 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nid1P10493 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nid1P10493 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nid1P10493 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nid1P10493 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nid1P10493 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nid1P10493 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nid1P10493 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nid1P10493 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Nid1P10493 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nid1P10493 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nid1P10493 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Nid1P10493 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nid1P10493 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nid1P10493 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Nid1P10493 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nid1P10493 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nid1P10493 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nid1P10493 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nid1P10493 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nid1P10493 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nid1P10493 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nid1P10493 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nid1P10493 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nid1P10493 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nid1P10493 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nid1P10493 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nid1P10493 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nid1P10493 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Nid1P10493 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nid1P10493 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Nid1P10493 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nid1P10493 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nid1P10493 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nid1P10493 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nid1P10493 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nid1P10493 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nid1P10493 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nid1P10493 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nid1P10493 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nid1P10493 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nid1P10493 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nid1P10493 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nid1P10493 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nid1P10493 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nid1P10493 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nid1P10493 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nid1P10493 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nid1P10493 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nid1P10493 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nid1P10493 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nid1P10493 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nid1P10493 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nid1P10493 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nid1P10493 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nid1P10493 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nid1P10493 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nid1P10493 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nid1P10493 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nid1P10493 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nid1P10493 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms