Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CatspereP0DP43 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CatspereP0DP43 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CatspereP0DP43 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CatspereP0DP43 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CatspereP0DP43 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CatspereP0DP43 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CatspereP0DP43 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CatspereP0DP43 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
CatspereP0DP43 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CatspereP0DP43 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CatspereP0DP43 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CatspereP0DP43 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CatspereP0DP43 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CatspereP0DP43 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CatspereP0DP43 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CatspereP0DP43 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CatspereP0DP43 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CatspereP0DP43 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CatspereP0DP43 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CatspereP0DP43 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CatspereP0DP43 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CatspereP0DP43 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CatspereP0DP43 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CatspereP0DP43 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CatspereP0DP43 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CatspereP0DP43 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CatspereP0DP43 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CatspereP0DP43 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CatspereP0DP43 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CatspereP0DP43 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CatspereP0DP43 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CatspereP0DP43 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CatspereP0DP43 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CatspereP0DP43 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CatspereP0DP43 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CatspereP0DP43 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CatspereP0DP43 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CatspereP0DP43 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CatspereP0DP43 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CatspereP0DP43 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CatspereP0DP43 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CatspereP0DP43 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CatspereP0DP43 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CatspereP0DP43 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CatspereP0DP43 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CatspereP0DP43 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CatspereP0DP43 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CatspereP0DP43 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CatspereP0DP43 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CatspereP0DP43 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CatspereP0DP43 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CatspereP0DP43 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CatspereP0DP43 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CatspereP0DP43 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CatspereP0DP43 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CatspereP0DP43 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CatspereP0DP43 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CatspereP0DP43 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CatspereP0DP43 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CatspereP0DP43 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CatspereP0DP43 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CatspereP0DP43 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CatspereP0DP43 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CatspereP0DP43 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CatspereP0DP43 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CatspereP0DP43 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CatspereP0DP43 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CatspereP0DP43 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CatspereP0DP43 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CatspereP0DP43 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CatspereP0DP43 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CatspereP0DP43 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CatspereP0DP43 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CatspereP0DP43 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CatspereP0DP43 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CatspereP0DP43 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CatspereP0DP43 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CatspereP0DP43 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CatspereP0DP43 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CatspereP0DP43 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CatspereP0DP43 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CatspereP0DP43 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CatspereP0DP43 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CatspereP0DP43 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CatspereP0DP43 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CatspereP0DP43 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CatspereP0DP43 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CatspereP0DP43 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CatspereP0DP43 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CatspereP0DP43 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CatspereP0DP43 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CatspereP0DP43 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CatspereP0DP43 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CatspereP0DP43 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CatspereP0DP43 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CatspereP0DP43 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CatspereP0DP43 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CatspereP0DP43 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CatspereP0DP43 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms