Protein–RNA interactions for Protein: P0DN90

Tmem254b, Transmembrane protein 254b, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem254bP0DN90 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem254bP0DN90 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem254bP0DN90 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem254bP0DN90 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem254bP0DN90 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem254bP0DN90 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem254bP0DN90 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem254bP0DN90 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem254bP0DN90 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem254bP0DN90 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem254bP0DN90 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem254bP0DN90 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem254bP0DN90 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tmem254bP0DN90 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem254bP0DN90 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem254bP0DN90 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem254bP0DN90 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem254bP0DN90 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem254bP0DN90 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem254bP0DN90 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem254bP0DN90 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem254bP0DN90 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem254bP0DN90 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem254bP0DN90 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem254bP0DN90 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem254bP0DN90 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem254bP0DN90 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem254bP0DN90 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem254bP0DN90 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem254bP0DN90 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem254bP0DN90 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem254bP0DN90 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tmem254bP0DN90 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem254bP0DN90 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem254bP0DN90 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem254bP0DN90 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem254bP0DN90 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem254bP0DN90 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem254bP0DN90 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem254bP0DN90 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem254bP0DN90 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem254bP0DN90 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem254bP0DN90 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem254bP0DN90 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem254bP0DN90 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem254bP0DN90 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem254bP0DN90 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem254bP0DN90 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem254bP0DN90 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem254bP0DN90 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem254bP0DN90 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem254bP0DN90 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem254bP0DN90 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem254bP0DN90 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem254bP0DN90 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem254bP0DN90 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem254bP0DN90 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem254bP0DN90 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem254bP0DN90 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem254bP0DN90 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem254bP0DN90 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem254bP0DN90 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem254bP0DN90 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem254bP0DN90 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem254bP0DN90 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem254bP0DN90 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Tmem254bP0DN90 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem254bP0DN90 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem254bP0DN90 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem254bP0DN90 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem254bP0DN90 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem254bP0DN90 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem254bP0DN90 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem254bP0DN90 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem254bP0DN90 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem254bP0DN90 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem254bP0DN90 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem254bP0DN90 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem254bP0DN90 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem254bP0DN90 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem254bP0DN90 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem254bP0DN90 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem254bP0DN90 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem254bP0DN90 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem254bP0DN90 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem254bP0DN90 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem254bP0DN90 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem254bP0DN90 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem254bP0DN90 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem254bP0DN90 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem254bP0DN90 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem254bP0DN90 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem254bP0DN90 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem254bP0DN90 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem254bP0DN90 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem254bP0DN90 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem254bP0DN90 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem254bP0DN90 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem254bP0DN90 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tmem254bP0DN90 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms