Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Amd1P0DMN7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Amd1P0DMN7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Amd1P0DMN7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Amd1P0DMN7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Amd1P0DMN7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Amd1P0DMN7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Amd1P0DMN7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Amd1P0DMN7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Amd1P0DMN7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Amd1P0DMN7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Amd1P0DMN7 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Amd1P0DMN7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Amd1P0DMN7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Amd1P0DMN7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Amd1P0DMN7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Amd1P0DMN7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Amd1P0DMN7 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Amd1P0DMN7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Amd1P0DMN7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Amd1P0DMN7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Amd1P0DMN7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Amd1P0DMN7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Amd1P0DMN7 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Amd1P0DMN7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Amd1P0DMN7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Amd1P0DMN7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Amd1P0DMN7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Amd1P0DMN7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Amd1P0DMN7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Amd1P0DMN7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Amd1P0DMN7 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Amd1P0DMN7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Amd1P0DMN7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Amd1P0DMN7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Amd1P0DMN7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Amd1P0DMN7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Amd1P0DMN7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Amd1P0DMN7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Amd1P0DMN7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Amd1P0DMN7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Amd1P0DMN7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Amd1P0DMN7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Amd1P0DMN7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Amd1P0DMN7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Amd1P0DMN7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Amd1P0DMN7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Amd1P0DMN7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Amd1P0DMN7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Amd1P0DMN7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Amd1P0DMN7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Amd1P0DMN7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Amd1P0DMN7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Amd1P0DMN7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Amd1P0DMN7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Amd1P0DMN7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Amd1P0DMN7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Amd1P0DMN7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Amd1P0DMN7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Amd1P0DMN7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms