Protein–RNA interactions for Protein: P0CW02

Ly6c1, Lymphocyte antigen 6C1, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6c1P0CW02 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ly6c1P0CW02 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ly6c1P0CW02 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ly6c1P0CW02 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ly6c1P0CW02 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ly6c1P0CW02 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ly6c1P0CW02 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Ly6c1P0CW02 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ly6c1P0CW02 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms