Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UbbP0CG49 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UbbP0CG49 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UbbP0CG49 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UbbP0CG49 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UbbP0CG49 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
UbbP0CG49 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UbbP0CG49 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UbbP0CG49 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UbbP0CG49 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UbbP0CG49 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms