Protein–RNA interactions for Protein: P09025

Hoxc8, Homeobox protein Hox-C8, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc8P09025 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxc8P09025 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxc8P09025 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxc8P09025 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxc8P09025 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxc8P09025 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxc8P09025 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxc8P09025 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxc8P09025 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxc8P09025 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxc8P09025 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxc8P09025 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxc8P09025 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxc8P09025 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxc8P09025 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxc8P09025 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxc8P09025 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxc8P09025 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxc8P09025 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxc8P09025 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxc8P09025 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxc8P09025 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxc8P09025 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxc8P09025 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxc8P09025 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxc8P09025 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxc8P09025 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxc8P09025 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxc8P09025 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxc8P09025 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxc8P09025 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxc8P09025 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxc8P09025 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxc8P09025 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxc8P09025 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxc8P09025 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxc8P09025 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxc8P09025 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxc8P09025 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Hoxc8P09025 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Hoxc8P09025 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Hoxc8P09025 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxc8P09025 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxc8P09025 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxc8P09025 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxc8P09025 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxc8P09025 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxc8P09025 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxc8P09025 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxc8P09025 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxc8P09025 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxc8P09025 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxc8P09025 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxc8P09025 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxc8P09025 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxc8P09025 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxc8P09025 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxc8P09025 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxc8P09025 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxc8P09025 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxc8P09025 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxc8P09025 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxc8P09025 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxc8P09025 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxc8P09025 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxc8P09025 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxc8P09025 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxc8P09025 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxc8P09025 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxc8P09025 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxc8P09025 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxc8P09025 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxc8P09025 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxc8P09025 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxc8P09025 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxc8P09025 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxc8P09025 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxc8P09025 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxc8P09025 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxc8P09025 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxc8P09025 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxc8P09025 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxc8P09025 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxc8P09025 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxc8P09025 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxc8P09025 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxc8P09025 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxc8P09025 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxc8P09025 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxc8P09025 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxc8P09025 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxc8P09025 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxc8P09025 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxc8P09025 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxc8P09025 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxc8P09025 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxc8P09025 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxc8P09025 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxc8P09025 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxc8P09025 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms