Protein–RNA interactions for Protein: P08551

Nefl, Neurofilament light polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeflP08551 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NeflP08551 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NeflP08551 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NeflP08551 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NeflP08551 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NeflP08551 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NeflP08551 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NeflP08551 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NeflP08551 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NeflP08551 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NeflP08551 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NeflP08551 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NeflP08551 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NeflP08551 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NeflP08551 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NeflP08551 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NeflP08551 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NeflP08551 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NeflP08551 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NeflP08551 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NeflP08551 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NeflP08551 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NeflP08551 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NeflP08551 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NeflP08551 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NeflP08551 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NeflP08551 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NeflP08551 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NeflP08551 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NeflP08551 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NeflP08551 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NeflP08551 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NeflP08551 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NeflP08551 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NeflP08551 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NeflP08551 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NeflP08551 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NeflP08551 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NeflP08551 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NeflP08551 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NeflP08551 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NeflP08551 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NeflP08551 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NeflP08551 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NeflP08551 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NeflP08551 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NeflP08551 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NeflP08551 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NeflP08551 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NeflP08551 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NeflP08551 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NeflP08551 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NeflP08551 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NeflP08551 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NeflP08551 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NeflP08551 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NeflP08551 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NeflP08551 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NeflP08551 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NeflP08551 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NeflP08551 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NeflP08551 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NeflP08551 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NeflP08551 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NeflP08551 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NeflP08551 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NeflP08551 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NeflP08551 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NeflP08551 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NeflP08551 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NeflP08551 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NeflP08551 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NeflP08551 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NeflP08551 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NeflP08551 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NeflP08551 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NeflP08551 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NeflP08551 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NeflP08551 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NeflP08551 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NeflP08551 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NeflP08551 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NeflP08551 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NeflP08551 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NeflP08551 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NeflP08551 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NeflP08551 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NeflP08551 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NeflP08551 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NeflP08551 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NeflP08551 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NeflP08551 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NeflP08551 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NeflP08551 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NeflP08551 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NeflP08551 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NeflP08551 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NeflP08551 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NeflP08551 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NeflP08551 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms