Protein–RNA interactions for Protein: P07350

Ifna6, Interferon alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna6P07350 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ifna6P07350 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms