Protein–RNA interactions for Protein: P07321

Epo, Erythropoietin, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EpoP07321 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EpoP07321 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
EpoP07321 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
EpoP07321 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
EpoP07321 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EpoP07321 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EpoP07321 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EpoP07321 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EpoP07321 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EpoP07321 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EpoP07321 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EpoP07321 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EpoP07321 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
EpoP07321 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EpoP07321 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EpoP07321 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EpoP07321 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EpoP07321 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EpoP07321 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EpoP07321 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EpoP07321 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EpoP07321 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EpoP07321 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EpoP07321 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EpoP07321 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
EpoP07321 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EpoP07321 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EpoP07321 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
EpoP07321 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EpoP07321 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EpoP07321 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EpoP07321 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EpoP07321 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EpoP07321 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EpoP07321 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EpoP07321 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EpoP07321 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EpoP07321 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EpoP07321 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EpoP07321 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EpoP07321 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EpoP07321 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EpoP07321 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EpoP07321 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EpoP07321 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
EpoP07321 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EpoP07321 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
EpoP07321 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EpoP07321 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EpoP07321 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EpoP07321 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EpoP07321 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EpoP07321 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EpoP07321 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EpoP07321 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EpoP07321 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
EpoP07321 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EpoP07321 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EpoP07321 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EpoP07321 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EpoP07321 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
EpoP07321 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EpoP07321 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EpoP07321 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EpoP07321 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EpoP07321 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EpoP07321 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EpoP07321 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EpoP07321 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EpoP07321 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EpoP07321 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EpoP07321 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EpoP07321 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EpoP07321 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EpoP07321 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EpoP07321 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EpoP07321 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EpoP07321 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EpoP07321 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EpoP07321 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EpoP07321 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EpoP07321 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EpoP07321 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
EpoP07321 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EpoP07321 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
EpoP07321 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EpoP07321 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EpoP07321 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EpoP07321 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
EpoP07321 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EpoP07321 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EpoP07321 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EpoP07321 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
EpoP07321 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EpoP07321 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EpoP07321 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EpoP07321 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EpoP07321 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EpoP07321 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EpoP07321 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms