Protein–RNA interactions for Protein: P07141

Csf1, Macrophage colony-stimulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf1P07141 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csf1P07141 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csf1P07141 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csf1P07141 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csf1P07141 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csf1P07141 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csf1P07141 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csf1P07141 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csf1P07141 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csf1P07141 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csf1P07141 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Csf1P07141 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Csf1P07141 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Csf1P07141 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csf1P07141 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csf1P07141 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csf1P07141 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Csf1P07141 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csf1P07141 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csf1P07141 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csf1P07141 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csf1P07141 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csf1P07141 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csf1P07141 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csf1P07141 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csf1P07141 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csf1P07141 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csf1P07141 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csf1P07141 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csf1P07141 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csf1P07141 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csf1P07141 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csf1P07141 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Csf1P07141 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csf1P07141 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csf1P07141 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csf1P07141 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csf1P07141 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csf1P07141 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csf1P07141 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csf1P07141 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csf1P07141 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csf1P07141 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csf1P07141 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csf1P07141 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csf1P07141 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Csf1P07141 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csf1P07141 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csf1P07141 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csf1P07141 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csf1P07141 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csf1P07141 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csf1P07141 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Csf1P07141 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Csf1P07141 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csf1P07141 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csf1P07141 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csf1P07141 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csf1P07141 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csf1P07141 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csf1P07141 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Csf1P07141 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Csf1P07141 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csf1P07141 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csf1P07141 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csf1P07141 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csf1P07141 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csf1P07141 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csf1P07141 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csf1P07141 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csf1P07141 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csf1P07141 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Csf1P07141 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csf1P07141 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csf1P07141 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csf1P07141 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csf1P07141 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csf1P07141 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csf1P07141 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csf1P07141 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csf1P07141 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csf1P07141 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csf1P07141 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csf1P07141 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csf1P07141 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Csf1P07141 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csf1P07141 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csf1P07141 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csf1P07141 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csf1P07141 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csf1P07141 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csf1P07141 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Csf1P07141 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Csf1P07141 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csf1P07141 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csf1P07141 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csf1P07141 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csf1P07141 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csf1P07141 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csf1P07141 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms