Protein–RNA interactions for Protein: P06325

Tcrg-V1, T-cell receptor gamma chain V region 5/10-13, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcrg-V1P06325 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tcrg-V1P06325 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcrg-V1P06325 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcrg-V1P06325 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcrg-V1P06325 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcrg-V1P06325 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcrg-V1P06325 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcrg-V1P06325 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcrg-V1P06325 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcrg-V1P06325 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcrg-V1P06325 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcrg-V1P06325 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcrg-V1P06325 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcrg-V1P06325 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcrg-V1P06325 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcrg-V1P06325 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcrg-V1P06325 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcrg-V1P06325 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcrg-V1P06325 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcrg-V1P06325 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcrg-V1P06325 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcrg-V1P06325 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcrg-V1P06325 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tcrg-V1P06325 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcrg-V1P06325 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcrg-V1P06325 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcrg-V1P06325 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcrg-V1P06325 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcrg-V1P06325 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcrg-V1P06325 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcrg-V1P06325 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcrg-V1P06325 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcrg-V1P06325 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcrg-V1P06325 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcrg-V1P06325 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcrg-V1P06325 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcrg-V1P06325 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcrg-V1P06325 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcrg-V1P06325 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcrg-V1P06325 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcrg-V1P06325 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcrg-V1P06325 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcrg-V1P06325 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcrg-V1P06325 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcrg-V1P06325 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcrg-V1P06325 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcrg-V1P06325 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcrg-V1P06325 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcrg-V1P06325 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcrg-V1P06325 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcrg-V1P06325 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcrg-V1P06325 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcrg-V1P06325 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcrg-V1P06325 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcrg-V1P06325 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcrg-V1P06325 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcrg-V1P06325 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcrg-V1P06325 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcrg-V1P06325 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcrg-V1P06325 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcrg-V1P06325 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcrg-V1P06325 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcrg-V1P06325 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcrg-V1P06325 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcrg-V1P06325 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcrg-V1P06325 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcrg-V1P06325 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcrg-V1P06325 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcrg-V1P06325 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcrg-V1P06325 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcrg-V1P06325 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcrg-V1P06325 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tcrg-V1P06325 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tcrg-V1P06325 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tcrg-V1P06325 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tcrg-V1P06325 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tcrg-V1P06325 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tcrg-V1P06325 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tcrg-V1P06325 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tcrg-V1P06325 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tcrg-V1P06325 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tcrg-V1P06325 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcrg-V1P06325 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcrg-V1P06325 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcrg-V1P06325 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcrg-V1P06325 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcrg-V1P06325 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcrg-V1P06325 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcrg-V1P06325 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcrg-V1P06325 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcrg-V1P06325 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcrg-V1P06325 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcrg-V1P06325 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcrg-V1P06325 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcrg-V1P06325 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcrg-V1P06325 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcrg-V1P06325 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcrg-V1P06325 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcrg-V1P06325 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcrg-V1P06325 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms