Protein–RNA interactions for Protein: P06323

T-cell receptor alpha chain V region CTL-F3, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06323 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06323 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06323 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06323 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06323 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06323 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06323 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06323 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06323 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06323 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06323 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
P06323 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
P06323 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P06323 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P06323 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P06323 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P06323 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P06323 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P06323 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P06323 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P06323 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P06323 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P06323 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P06323 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
P06323 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P06323 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P06323 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P06323 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P06323 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P06323 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P06323 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
P06323 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P06323 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P06323 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P06323 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P06323 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P06323 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P06323 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P06323 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P06323 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P06323 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P06323 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P06323 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P06323 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P06323 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P06323 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P06323 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P06323 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P06323 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P06323 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P06323 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P06323 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P06323 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P06323 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P06323 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P06323 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P06323 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P06323 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06323 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06323 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06323 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06323 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06323 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06323 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06323 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06323 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06323 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06323 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06323 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06323 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06323 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06323 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06323 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06323 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06323 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06323 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06323 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06323 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06323 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06323 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06323 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06323 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06323 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06323 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06323 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P06323 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06323 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06323 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06323 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06323 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P06323 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06323 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P06323 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06323 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06323 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06323 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06323 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P06323 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06323 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06323 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms