Protein–RNA interactions for Protein: P05627

Jun, Transcription factor AP-1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JunP05627 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
JunP05627 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
JunP05627 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
JunP05627 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
JunP05627 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
JunP05627 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
JunP05627 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
JunP05627 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
JunP05627 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
JunP05627 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
JunP05627 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
JunP05627 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
JunP05627 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
JunP05627 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
JunP05627 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
JunP05627 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
JunP05627 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
JunP05627 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
JunP05627 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
JunP05627 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
JunP05627 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
JunP05627 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
JunP05627 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
JunP05627 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
JunP05627 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
JunP05627 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
JunP05627 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
JunP05627 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
JunP05627 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
JunP05627 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
JunP05627 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
JunP05627 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
JunP05627 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
JunP05627 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
JunP05627 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
JunP05627 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
JunP05627 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
JunP05627 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
JunP05627 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
JunP05627 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
JunP05627 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
JunP05627 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
JunP05627 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
JunP05627 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
JunP05627 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
JunP05627 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
JunP05627 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
JunP05627 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
JunP05627 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
JunP05627 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
JunP05627 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
JunP05627 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
JunP05627 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
JunP05627 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
JunP05627 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
JunP05627 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
JunP05627 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
JunP05627 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
JunP05627 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
JunP05627 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
JunP05627 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
JunP05627 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
JunP05627 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
JunP05627 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
JunP05627 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
JunP05627 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
JunP05627 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
JunP05627 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
JunP05627 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
JunP05627 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
JunP05627 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
JunP05627 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
JunP05627 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
JunP05627 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
JunP05627 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
JunP05627 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
JunP05627 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
JunP05627 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
JunP05627 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
JunP05627 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
JunP05627 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
JunP05627 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
JunP05627 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
JunP05627 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
JunP05627 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
JunP05627 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
JunP05627 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
JunP05627 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
JunP05627 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
JunP05627 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
JunP05627 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
JunP05627 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
JunP05627 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
JunP05627 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
JunP05627 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
JunP05627 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
JunP05627 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
JunP05627 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
JunP05627 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
JunP05627 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms