Protein–RNA interactions for Protein: P05555

Itgam, Integrin alpha-M, mousemouse

Predictions only

Length 1,153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgamP05555 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ItgamP05555 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ItgamP05555 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ItgamP05555 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ItgamP05555 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ItgamP05555 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ItgamP05555 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ItgamP05555 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ItgamP05555 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ItgamP05555 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ItgamP05555 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ItgamP05555 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ItgamP05555 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ItgamP05555 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ItgamP05555 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ItgamP05555 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ItgamP05555 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ItgamP05555 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ItgamP05555 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ItgamP05555 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ItgamP05555 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ItgamP05555 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ItgamP05555 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ItgamP05555 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ItgamP05555 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ItgamP05555 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ItgamP05555 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ItgamP05555 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ItgamP05555 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ItgamP05555 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ItgamP05555 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ItgamP05555 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ItgamP05555 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ItgamP05555 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ItgamP05555 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ItgamP05555 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ItgamP05555 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ItgamP05555 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ItgamP05555 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ItgamP05555 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ItgamP05555 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ItgamP05555 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ItgamP05555 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ItgamP05555 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ItgamP05555 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ItgamP05555 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ItgamP05555 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ItgamP05555 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ItgamP05555 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ItgamP05555 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ItgamP05555 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ItgamP05555 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ItgamP05555 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ItgamP05555 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ItgamP05555 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ItgamP05555 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ItgamP05555 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ItgamP05555 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ItgamP05555 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ItgamP05555 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ItgamP05555 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ItgamP05555 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ItgamP05555 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ItgamP05555 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ItgamP05555 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ItgamP05555 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ItgamP05555 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ItgamP05555 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ItgamP05555 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ItgamP05555 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ItgamP05555 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ItgamP05555 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ItgamP05555 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ItgamP05555 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ItgamP05555 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ItgamP05555 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ItgamP05555 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ItgamP05555 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ItgamP05555 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ItgamP05555 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ItgamP05555 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ItgamP05555 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ItgamP05555 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ItgamP05555 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ItgamP05555 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ItgamP05555 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ItgamP05555 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ItgamP05555 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ItgamP05555 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ItgamP05555 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ItgamP05555 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ItgamP05555 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ItgamP05555 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ItgamP05555 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ItgamP05555 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ItgamP05555 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ItgamP05555 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ItgamP05555 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ItgamP05555 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ItgamP05555 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms