Protein–RNA interactions for Protein: P02830

Hoxa7, Homeobox protein Hox-A7, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa7P02830 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxa7P02830 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxa7P02830 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxa7P02830 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxa7P02830 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxa7P02830 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxa7P02830 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxa7P02830 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxa7P02830 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxa7P02830 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxa7P02830 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxa7P02830 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxa7P02830 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxa7P02830 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxa7P02830 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxa7P02830 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxa7P02830 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxa7P02830 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxa7P02830 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxa7P02830 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxa7P02830 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxa7P02830 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxa7P02830 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxa7P02830 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxa7P02830 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxa7P02830 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxa7P02830 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxa7P02830 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxa7P02830 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxa7P02830 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxa7P02830 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxa7P02830 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxa7P02830 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxa7P02830 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxa7P02830 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxa7P02830 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxa7P02830 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxa7P02830 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxa7P02830 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxa7P02830 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxa7P02830 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxa7P02830 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxa7P02830 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxa7P02830 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxa7P02830 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxa7P02830 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxa7P02830 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxa7P02830 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxa7P02830 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxa7P02830 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxa7P02830 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxa7P02830 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxa7P02830 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxa7P02830 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxa7P02830 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxa7P02830 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxa7P02830 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxa7P02830 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxa7P02830 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxa7P02830 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxa7P02830 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxa7P02830 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxa7P02830 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxa7P02830 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxa7P02830 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxa7P02830 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxa7P02830 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxa7P02830 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxa7P02830 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxa7P02830 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxa7P02830 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxa7P02830 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxa7P02830 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxa7P02830 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxa7P02830 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxa7P02830 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxa7P02830 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxa7P02830 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxa7P02830 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxa7P02830 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxa7P02830 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxa7P02830 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxa7P02830 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxa7P02830 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxa7P02830 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxa7P02830 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxa7P02830 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxa7P02830 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxa7P02830 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxa7P02830 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxa7P02830 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxa7P02830 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxa7P02830 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxa7P02830 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxa7P02830 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxa7P02830 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxa7P02830 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxa7P02830 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxa7P02830 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxa7P02830 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms