Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-Ab1P01921 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-Ab1P01921 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-Ab1P01921 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2-Ab1P01921 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2-Ab1P01921 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2-Ab1P01921 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-Ab1P01921 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-Ab1P01921 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-Ab1P01921 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-Ab1P01921 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-Ab1P01921 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-Ab1P01921 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-Ab1P01921 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-Ab1P01921 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-Ab1P01921 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-Ab1P01921 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-Ab1P01921 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-Ab1P01921 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-Ab1P01921 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-Ab1P01921 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-Ab1P01921 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-Ab1P01921 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-Ab1P01921 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-Ab1P01921 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-Ab1P01921 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-Ab1P01921 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-Ab1P01921 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-Ab1P01921 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-Ab1P01921 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-Ab1P01921 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-Ab1P01921 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-Ab1P01921 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-Ab1P01921 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-Ab1P01921 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-Ab1P01921 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-Ab1P01921 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-Ab1P01921 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-Ab1P01921 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Ab1P01921 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Ab1P01921 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Ab1P01921 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Ab1P01921 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Ab1P01921 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Ab1P01921 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Ab1P01921 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Ab1P01921 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Ab1P01921 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Ab1P01921 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Ab1P01921 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Ab1P01921 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Ab1P01921 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Ab1P01921 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-Ab1P01921 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-Ab1P01921 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-Ab1P01921 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-Ab1P01921 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-Ab1P01921 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-Ab1P01921 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-Ab1P01921 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-Ab1P01921 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-Ab1P01921 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-Ab1P01921 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-Ab1P01921 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-Ab1P01921 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-Ab1P01921 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-Ab1P01921 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-Ab1P01921 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-Ab1P01921 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-Ab1P01921 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-Ab1P01921 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-Ab1P01921 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-Ab1P01921 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-Ab1P01921 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-Ab1P01921 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-Ab1P01921 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-Ab1P01921 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-Ab1P01921 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-Ab1P01921 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-Ab1P01921 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-Ab1P01921 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-Ab1P01921 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-Ab1P01921 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-Ab1P01921 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-Ab1P01921 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-Ab1P01921 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-Ab1P01921 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-Ab1P01921 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-Ab1P01921 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-Ab1P01921 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-Ab1P01921 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
H2-Ab1P01921 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-Ab1P01921 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-Ab1P01921 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-Ab1P01921 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-Ab1P01921 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-Ab1P01921 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-Ab1P01921 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-Ab1P01921 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-Ab1P01921 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms