Protein–RNA interactions for Protein: P01800

Ig heavy chain V-III region T957, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01800 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01800 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01800 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01800 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01800 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
P01800 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
P01800 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01800 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01800 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01800 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01800 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
P01800 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01800 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01800 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01800 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01800 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01800 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01800 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01800 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01800 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01800 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01800 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01800 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01800 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01800 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01800 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01800 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01800 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01800 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01800 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01800 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01800 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01800 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01800 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01800 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01800 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01800 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01800 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01800 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01800 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01800 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01800 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01800 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
P01800 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01800 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01800 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01800 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01800 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01800 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01800 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01800 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01800 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01800 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01800 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01800 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01800 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01800 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01800 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01800 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01800 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01800 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01800 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01800 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01800 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01800 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01800 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01800 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01800 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01800 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01800 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01800 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01800 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01800 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01800 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
P01800 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01800 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01800 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
P01800 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01800 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01800 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01800 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01800 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01800 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01800 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01800 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01800 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01800 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01800 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01800 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01800 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01800 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01800 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01800 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01800 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01800 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01800 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01800 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
P01800 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01800 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
P01800 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms