Protein–RNA interactions for Protein: P01798

Ig heavy chain V-III region E109, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01798 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01798 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01798 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01798 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01798 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01798 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P01798 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
P01798 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
P01798 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01798 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01798 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01798 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01798 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01798 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01798 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P01798 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01798 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01798 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01798 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01798 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P01798 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01798 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01798 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01798 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01798 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01798 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01798 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01798 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P01798 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P01798 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01798 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01798 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01798 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01798 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01798 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01798 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01798 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01798 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01798 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01798 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01798 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
P01798 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01798 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01798 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01798 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01798 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01798 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01798 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01798 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01798 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01798 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01798 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01798 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01798 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01798 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01798 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01798 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
P01798 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01798 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01798 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01798 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01798 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01798 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01798 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01798 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01798 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01798 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01798 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01798 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01798 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01798 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01798 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01798 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01798 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01798 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01798 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01798 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01798 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01798 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01798 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01798 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01798 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01798 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01798 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01798 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01798 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01798 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01798 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01798 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01798 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01798 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01798 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01798 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P01798 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01798 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01798 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01798 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01798 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01798 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01798 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms