Protein–RNA interactions for Protein: P01724

Ig lambda-1 chain V regions MOPC 104E/RPC20/J558/S104, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01724 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01724 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01724 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P01724 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01724 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01724 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01724 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01724 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01724 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01724 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01724 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01724 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01724 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01724 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01724 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01724 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01724 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01724 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01724 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01724 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P01724 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01724 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01724 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01724 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01724 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01724 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P01724 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01724 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01724 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P01724 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01724 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01724 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01724 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01724 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01724 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01724 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01724 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01724 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01724 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01724 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01724 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P01724 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01724 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01724 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01724 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01724 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01724 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01724 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01724 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01724 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01724 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01724 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01724 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01724 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01724 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01724 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01724 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01724 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01724 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01724 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01724 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01724 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01724 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P01724 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01724 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01724 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
P01724 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01724 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01724 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01724 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01724 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01724 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01724 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01724 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01724 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01724 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01724 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01724 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01724 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01724 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01724 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01724 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01724 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01724 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01724 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01724 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01724 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01724 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01724 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01724 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01724 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01724 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01724 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01724 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01724 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01724 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01724 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01724 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01724 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01724 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms