Protein–RNA interactions for Protein: P01633

Igk-V19-17, Ig kappa chain V19-17, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igk-V19-17P01633 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Igk-V19-17P01633 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Igk-V19-17P01633 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Igk-V19-17P01633 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Igk-V19-17P01633 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Igk-V19-17P01633 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Igk-V19-17P01633 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Igk-V19-17P01633 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Igk-V19-17P01633 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Igk-V19-17P01633 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Igk-V19-17P01633 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Igk-V19-17P01633 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Igk-V19-17P01633 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Igk-V19-17P01633 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Igk-V19-17P01633 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Igk-V19-17P01633 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Igk-V19-17P01633 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Igk-V19-17P01633 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Igk-V19-17P01633 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Igk-V19-17P01633 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Igk-V19-17P01633 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Igk-V19-17P01633 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Igk-V19-17P01633 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Igk-V19-17P01633 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Igk-V19-17P01633 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Igk-V19-17P01633 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Igk-V19-17P01633 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Igk-V19-17P01633 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Igk-V19-17P01633 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Igk-V19-17P01633 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Igk-V19-17P01633 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Igk-V19-17P01633 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Igk-V19-17P01633 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Igk-V19-17P01633 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Igk-V19-17P01633 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Igk-V19-17P01633 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Igk-V19-17P01633 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Igk-V19-17P01633 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Igk-V19-17P01633 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Igk-V19-17P01633 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Igk-V19-17P01633 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Igk-V19-17P01633 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Igk-V19-17P01633 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Igk-V19-17P01633 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Igk-V19-17P01633 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Igk-V19-17P01633 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Igk-V19-17P01633 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Igk-V19-17P01633 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Igk-V19-17P01633 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Igk-V19-17P01633 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Igk-V19-17P01633 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Igk-V19-17P01633 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Igk-V19-17P01633 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Igk-V19-17P01633 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Igk-V19-17P01633 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Igk-V19-17P01633 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Igk-V19-17P01633 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Igk-V19-17P01633 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Igk-V19-17P01633 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Igk-V19-17P01633 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Igk-V19-17P01633 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Igk-V19-17P01633 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Igk-V19-17P01633 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Igk-V19-17P01633 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Igk-V19-17P01633 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Igk-V19-17P01633 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Igk-V19-17P01633 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Igk-V19-17P01633 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Igk-V19-17P01633 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Igk-V19-17P01633 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Igk-V19-17P01633 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Igk-V19-17P01633 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Igk-V19-17P01633 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Igk-V19-17P01633 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Igk-V19-17P01633 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Igk-V19-17P01633 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Igk-V19-17P01633 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Igk-V19-17P01633 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Igk-V19-17P01633 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Igk-V19-17P01633 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Igk-V19-17P01633 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Igk-V19-17P01633 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Igk-V19-17P01633 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Igk-V19-17P01633 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Igk-V19-17P01633 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Igk-V19-17P01633 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Igk-V19-17P01633 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Igk-V19-17P01633 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Igk-V19-17P01633 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Igk-V19-17P01633 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Igk-V19-17P01633 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Igk-V19-17P01633 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Igk-V19-17P01633 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Igk-V19-17P01633 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Igk-V19-17P01633 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Igk-V19-17P01633 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Igk-V19-17P01633 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Igk-V19-17P01633 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Igk-V19-17P01633 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Igk-V19-17P01633 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms