Protein–RNA interactions for Protein: O88940

Msc, Musculin, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MscO88940 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
MscO88940 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MscO88940 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MscO88940 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
MscO88940 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MscO88940 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MscO88940 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MscO88940 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MscO88940 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MscO88940 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
MscO88940 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
MscO88940 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
MscO88940 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MscO88940 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MscO88940 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MscO88940 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MscO88940 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MscO88940 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MscO88940 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MscO88940 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MscO88940 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MscO88940 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MscO88940 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MscO88940 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MscO88940 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MscO88940 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MscO88940 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MscO88940 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MscO88940 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MscO88940 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MscO88940 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
MscO88940 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MscO88940 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MscO88940 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MscO88940 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MscO88940 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MscO88940 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MscO88940 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MscO88940 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MscO88940 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MscO88940 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MscO88940 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MscO88940 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MscO88940 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MscO88940 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MscO88940 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MscO88940 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MscO88940 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MscO88940 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MscO88940 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MscO88940 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MscO88940 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MscO88940 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MscO88940 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MscO88940 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MscO88940 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MscO88940 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MscO88940 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MscO88940 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MscO88940 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MscO88940 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MscO88940 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MscO88940 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MscO88940 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MscO88940 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MscO88940 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MscO88940 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MscO88940 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MscO88940 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MscO88940 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MscO88940 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MscO88940 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MscO88940 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MscO88940 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MscO88940 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MscO88940 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
MscO88940 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MscO88940 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
MscO88940 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MscO88940 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MscO88940 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MscO88940 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MscO88940 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
MscO88940 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MscO88940 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MscO88940 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MscO88940 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MscO88940 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MscO88940 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MscO88940 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
MscO88940 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MscO88940 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MscO88940 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MscO88940 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MscO88940 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MscO88940 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MscO88940 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MscO88940 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MscO88940 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
MscO88940 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms