Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
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CcnkO88874 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CcnkO88874 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CcnkO88874 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CcnkO88874 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CcnkO88874 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CcnkO88874 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CcnkO88874 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CcnkO88874 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CcnkO88874 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CcnkO88874 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CcnkO88874 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CcnkO88874 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CcnkO88874 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CcnkO88874 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CcnkO88874 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CcnkO88874 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CcnkO88874 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CcnkO88874 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CcnkO88874 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CcnkO88874 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CcnkO88874 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CcnkO88874 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CcnkO88874 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CcnkO88874 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CcnkO88874 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CcnkO88874 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CcnkO88874 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CcnkO88874 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CcnkO88874 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CcnkO88874 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CcnkO88874 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CcnkO88874 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CcnkO88874 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CcnkO88874 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CcnkO88874 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CcnkO88874 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CcnkO88874 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CcnkO88874 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CcnkO88874 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CcnkO88874 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CcnkO88874 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CcnkO88874 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CcnkO88874 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CcnkO88874 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CcnkO88874 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CcnkO88874 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CcnkO88874 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CcnkO88874 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CcnkO88874 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CcnkO88874 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CcnkO88874 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CcnkO88874 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CcnkO88874 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CcnkO88874 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CcnkO88874 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CcnkO88874 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CcnkO88874 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CcnkO88874 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CcnkO88874 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CcnkO88874 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CcnkO88874 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CcnkO88874 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CcnkO88874 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CcnkO88874 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CcnkO88874 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CcnkO88874 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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CcnkO88874 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CcnkO88874 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CcnkO88874 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CcnkO88874 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CcnkO88874 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CcnkO88874 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CcnkO88874 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CcnkO88874 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CcnkO88874 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CcnkO88874 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CcnkO88874 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CcnkO88874 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CcnkO88874 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CcnkO88874 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CcnkO88874 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CcnkO88874 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CcnkO88874 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CcnkO88874 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CcnkO88874 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CcnkO88874 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CcnkO88874 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CcnkO88874 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CcnkO88874 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CcnkO88874 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CcnkO88874 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CcnkO88874 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CcnkO88874 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CcnkO88874 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CcnkO88874 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CcnkO88874 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CcnkO88874 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms