Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnmt3bO88509 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnmt3bO88509 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnmt3bO88509 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnmt3bO88509 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnmt3bO88509 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnmt3bO88509 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnmt3bO88509 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnmt3bO88509 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnmt3bO88509 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnmt3bO88509 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnmt3bO88509 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnmt3bO88509 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dnmt3bO88509 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dnmt3bO88509 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Dnmt3bO88509 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Dnmt3bO88509 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dnmt3bO88509 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dnmt3bO88509 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dnmt3bO88509 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dnmt3bO88509 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dnmt3bO88509 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dnmt3bO88509 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dnmt3bO88509 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnmt3bO88509 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnmt3bO88509 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnmt3bO88509 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnmt3bO88509 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnmt3bO88509 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnmt3bO88509 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnmt3bO88509 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnmt3bO88509 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnmt3bO88509 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnmt3bO88509 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnmt3bO88509 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnmt3bO88509 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnmt3bO88509 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnmt3bO88509 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnmt3bO88509 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnmt3bO88509 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnmt3bO88509 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnmt3bO88509 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnmt3bO88509 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnmt3bO88509 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnmt3bO88509 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnmt3bO88509 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnmt3bO88509 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnmt3bO88509 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnmt3bO88509 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnmt3bO88509 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnmt3bO88509 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnmt3bO88509 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnmt3bO88509 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnmt3bO88509 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnmt3bO88509 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnmt3bO88509 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnmt3bO88509 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnmt3bO88509 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnmt3bO88509 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnmt3bO88509 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnmt3bO88509 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnmt3bO88509 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnmt3bO88509 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnmt3bO88509 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnmt3bO88509 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnmt3bO88509 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnmt3bO88509 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnmt3bO88509 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnmt3bO88509 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnmt3bO88509 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnmt3bO88509 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnmt3bO88509 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnmt3bO88509 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnmt3bO88509 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnmt3bO88509 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnmt3bO88509 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnmt3bO88509 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnmt3bO88509 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnmt3bO88509 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnmt3bO88509 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnmt3bO88509 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnmt3bO88509 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnmt3bO88509 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnmt3bO88509 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnmt3bO88509 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnmt3bO88509 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnmt3bO88509 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnmt3bO88509 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnmt3bO88509 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnmt3bO88509 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dnmt3bO88509 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnmt3bO88509 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnmt3bO88509 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnmt3bO88509 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnmt3bO88509 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnmt3bO88509 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnmt3bO88509 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnmt3bO88509 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnmt3bO88509 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dnmt3bO88509 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms