Protein–RNA interactions for Protein: O88425

Nme6, Nucleoside diphosphate kinase 6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme6O88425 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nme6O88425 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nme6O88425 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nme6O88425 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nme6O88425 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nme6O88425 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nme6O88425 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nme6O88425 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nme6O88425 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nme6O88425 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nme6O88425 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nme6O88425 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nme6O88425 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nme6O88425 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nme6O88425 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nme6O88425 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nme6O88425 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nme6O88425 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nme6O88425 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nme6O88425 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nme6O88425 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nme6O88425 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nme6O88425 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nme6O88425 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nme6O88425 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nme6O88425 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nme6O88425 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nme6O88425 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nme6O88425 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nme6O88425 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nme6O88425 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nme6O88425 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nme6O88425 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nme6O88425 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nme6O88425 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nme6O88425 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nme6O88425 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nme6O88425 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nme6O88425 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nme6O88425 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nme6O88425 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nme6O88425 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nme6O88425 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nme6O88425 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nme6O88425 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nme6O88425 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nme6O88425 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nme6O88425 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nme6O88425 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nme6O88425 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nme6O88425 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nme6O88425 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nme6O88425 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nme6O88425 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nme6O88425 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Nme6O88425 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Nme6O88425 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nme6O88425 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nme6O88425 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nme6O88425 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nme6O88425 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nme6O88425 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nme6O88425 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nme6O88425 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nme6O88425 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nme6O88425 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nme6O88425 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nme6O88425 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nme6O88425 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nme6O88425 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nme6O88425 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nme6O88425 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nme6O88425 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nme6O88425 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nme6O88425 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nme6O88425 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nme6O88425 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nme6O88425 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nme6O88425 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nme6O88425 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nme6O88425 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nme6O88425 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nme6O88425 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nme6O88425 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nme6O88425 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Nme6O88425 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Nme6O88425 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nme6O88425 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nme6O88425 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nme6O88425 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nme6O88425 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nme6O88425 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nme6O88425 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nme6O88425 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nme6O88425 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nme6O88425 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nme6O88425 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nme6O88425 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nme6O88425 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nme6O88425 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms