Protein–RNA interactions for Protein: O88255

Gm10509, Mszf57 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10509O88255 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Gm10509O88255 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
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Gm10509O88255 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Gm10509O88255 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm10509O88255 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm10509O88255 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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