Protein–RNA interactions for Protein: O70174

Chrna4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna4O70174 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chrna4O70174 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chrna4O70174 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chrna4O70174 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chrna4O70174 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Chrna4O70174 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Chrna4O70174 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Chrna4O70174 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Chrna4O70174 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Chrna4O70174 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Chrna4O70174 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Chrna4O70174 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Chrna4O70174 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Chrna4O70174 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Chrna4O70174 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Chrna4O70174 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Chrna4O70174 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chrna4O70174 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chrna4O70174 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chrna4O70174 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chrna4O70174 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chrna4O70174 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chrna4O70174 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chrna4O70174 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chrna4O70174 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chrna4O70174 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chrna4O70174 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chrna4O70174 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Chrna4O70174 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chrna4O70174 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chrna4O70174 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chrna4O70174 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chrna4O70174 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chrna4O70174 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chrna4O70174 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chrna4O70174 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chrna4O70174 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Chrna4O70174 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Chrna4O70174 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Chrna4O70174 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Chrna4O70174 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Chrna4O70174 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Chrna4O70174 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Chrna4O70174 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Chrna4O70174 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Chrna4O70174 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Chrna4O70174 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Chrna4O70174 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Chrna4O70174 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Chrna4O70174 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chrna4O70174 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chrna4O70174 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chrna4O70174 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chrna4O70174 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chrna4O70174 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chrna4O70174 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chrna4O70174 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chrna4O70174 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chrna4O70174 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Chrna4O70174 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chrna4O70174 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chrna4O70174 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chrna4O70174 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chrna4O70174 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chrna4O70174 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chrna4O70174 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chrna4O70174 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chrna4O70174 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chrna4O70174 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chrna4O70174 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chrna4O70174 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Chrna4O70174 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Chrna4O70174 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Chrna4O70174 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Chrna4O70174 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Chrna4O70174 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Chrna4O70174 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Chrna4O70174 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Chrna4O70174 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Chrna4O70174 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Chrna4O70174 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chrna4O70174 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chrna4O70174 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chrna4O70174 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chrna4O70174 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chrna4O70174 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chrna4O70174 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chrna4O70174 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chrna4O70174 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chrna4O70174 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chrna4O70174 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chrna4O70174 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Chrna4O70174 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Chrna4O70174 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chrna4O70174 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Chrna4O70174 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chrna4O70174 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chrna4O70174 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chrna4O70174 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chrna4O70174 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms