Protein–RNA interactions for Protein: O55230

Rad51d, DNA repair protein RAD51 homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad51dO55230 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rad51dO55230 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rad51dO55230 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rad51dO55230 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rad51dO55230 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rad51dO55230 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rad51dO55230 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rad51dO55230 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rad51dO55230 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rad51dO55230 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rad51dO55230 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rad51dO55230 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rad51dO55230 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rad51dO55230 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rad51dO55230 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rad51dO55230 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Rad51dO55230 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rad51dO55230 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rad51dO55230 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rad51dO55230 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rad51dO55230 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rad51dO55230 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rad51dO55230 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rad51dO55230 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rad51dO55230 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rad51dO55230 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rad51dO55230 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rad51dO55230 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rad51dO55230 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rad51dO55230 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rad51dO55230 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rad51dO55230 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rad51dO55230 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rad51dO55230 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rad51dO55230 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rad51dO55230 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rad51dO55230 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rad51dO55230 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rad51dO55230 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rad51dO55230 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rad51dO55230 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rad51dO55230 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rad51dO55230 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rad51dO55230 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rad51dO55230 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rad51dO55230 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rad51dO55230 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rad51dO55230 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rad51dO55230 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rad51dO55230 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rad51dO55230 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rad51dO55230 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rad51dO55230 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rad51dO55230 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rad51dO55230 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rad51dO55230 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rad51dO55230 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rad51dO55230 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rad51dO55230 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rad51dO55230 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rad51dO55230 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rad51dO55230 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rad51dO55230 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rad51dO55230 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rad51dO55230 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rad51dO55230 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rad51dO55230 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rad51dO55230 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rad51dO55230 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rad51dO55230 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rad51dO55230 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rad51dO55230 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rad51dO55230 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rad51dO55230 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rad51dO55230 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rad51dO55230 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rad51dO55230 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rad51dO55230 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rad51dO55230 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rad51dO55230 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rad51dO55230 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rad51dO55230 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rad51dO55230 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rad51dO55230 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rad51dO55230 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rad51dO55230 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rad51dO55230 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rad51dO55230 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rad51dO55230 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rad51dO55230 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rad51dO55230 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rad51dO55230 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rad51dO55230 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rad51dO55230 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rad51dO55230 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rad51dO55230 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rad51dO55230 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rad51dO55230 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rad51dO55230 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rad51dO55230 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms