Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dsg2O55111 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dsg2O55111 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dsg2O55111 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dsg2O55111 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dsg2O55111 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dsg2O55111 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dsg2O55111 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dsg2O55111 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dsg2O55111 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dsg2O55111 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Dsg2O55111 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dsg2O55111 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dsg2O55111 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dsg2O55111 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dsg2O55111 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Dsg2O55111 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Dsg2O55111 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Dsg2O55111 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Dsg2O55111 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dsg2O55111 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dsg2O55111 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dsg2O55111 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dsg2O55111 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dsg2O55111 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dsg2O55111 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Dsg2O55111 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dsg2O55111 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dsg2O55111 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dsg2O55111 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dsg2O55111 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dsg2O55111 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dsg2O55111 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dsg2O55111 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dsg2O55111 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dsg2O55111 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dsg2O55111 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dsg2O55111 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dsg2O55111 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dsg2O55111 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dsg2O55111 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dsg2O55111 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dsg2O55111 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dsg2O55111 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dsg2O55111 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dsg2O55111 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dsg2O55111 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dsg2O55111 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dsg2O55111 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dsg2O55111 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dsg2O55111 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dsg2O55111 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dsg2O55111 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dsg2O55111 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dsg2O55111 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dsg2O55111 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dsg2O55111 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dsg2O55111 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dsg2O55111 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dsg2O55111 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dsg2O55111 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dsg2O55111 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dsg2O55111 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dsg2O55111 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Dsg2O55111 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Dsg2O55111 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dsg2O55111 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dsg2O55111 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dsg2O55111 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dsg2O55111 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dsg2O55111 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dsg2O55111 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dsg2O55111 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dsg2O55111 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dsg2O55111 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dsg2O55111 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dsg2O55111 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dsg2O55111 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dsg2O55111 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dsg2O55111 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dsg2O55111 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dsg2O55111 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dsg2O55111 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dsg2O55111 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Dsg2O55111 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dsg2O55111 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dsg2O55111 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dsg2O55111 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dsg2O55111 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dsg2O55111 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dsg2O55111 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dsg2O55111 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dsg2O55111 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dsg2O55111 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dsg2O55111 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dsg2O55111 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dsg2O55111 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dsg2O55111 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dsg2O55111 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dsg2O55111 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms