Protein–RNA interactions for Protein: O55103

Prx, Periaxin, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrxO55103 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PrxO55103 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PrxO55103 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PrxO55103 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PrxO55103 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PrxO55103 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PrxO55103 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PrxO55103 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PrxO55103 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PrxO55103 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PrxO55103 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PrxO55103 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PrxO55103 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PrxO55103 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PrxO55103 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PrxO55103 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PrxO55103 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PrxO55103 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PrxO55103 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PrxO55103 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PrxO55103 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PrxO55103 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PrxO55103 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PrxO55103 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PrxO55103 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PrxO55103 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PrxO55103 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PrxO55103 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PrxO55103 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PrxO55103 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PrxO55103 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PrxO55103 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PrxO55103 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PrxO55103 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PrxO55103 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PrxO55103 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PrxO55103 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PrxO55103 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PrxO55103 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PrxO55103 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PrxO55103 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PrxO55103 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PrxO55103 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PrxO55103 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
PrxO55103 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PrxO55103 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PrxO55103 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PrxO55103 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PrxO55103 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PrxO55103 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PrxO55103 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PrxO55103 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PrxO55103 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PrxO55103 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PrxO55103 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PrxO55103 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PrxO55103 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PrxO55103 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PrxO55103 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PrxO55103 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PrxO55103 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PrxO55103 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PrxO55103 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PrxO55103 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PrxO55103 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PrxO55103 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PrxO55103 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PrxO55103 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PrxO55103 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PrxO55103 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PrxO55103 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PrxO55103 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PrxO55103 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PrxO55103 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PrxO55103 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PrxO55103 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PrxO55103 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PrxO55103 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PrxO55103 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PrxO55103 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PrxO55103 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PrxO55103 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PrxO55103 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PrxO55103 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PrxO55103 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PrxO55103 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PrxO55103 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PrxO55103 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PrxO55103 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PrxO55103 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PrxO55103 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PrxO55103 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PrxO55103 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PrxO55103 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PrxO55103 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PrxO55103 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PrxO55103 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PrxO55103 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PrxO55103 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PrxO55103 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms