Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Copb2O55029 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Copb2O55029 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Copb2O55029 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Copb2O55029 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Copb2O55029 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Copb2O55029 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Copb2O55029 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Copb2O55029 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Copb2O55029 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Copb2O55029 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Copb2O55029 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Copb2O55029 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Copb2O55029 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Copb2O55029 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Copb2O55029 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Copb2O55029 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Copb2O55029 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Copb2O55029 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Copb2O55029 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Copb2O55029 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Copb2O55029 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Copb2O55029 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Copb2O55029 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Copb2O55029 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Copb2O55029 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Copb2O55029 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Copb2O55029 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Copb2O55029 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Copb2O55029 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Copb2O55029 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Copb2O55029 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Copb2O55029 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Copb2O55029 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Copb2O55029 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Copb2O55029 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Copb2O55029 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Copb2O55029 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Copb2O55029 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Copb2O55029 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Copb2O55029 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Copb2O55029 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Copb2O55029 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Copb2O55029 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Copb2O55029 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Copb2O55029 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Copb2O55029 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Copb2O55029 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Copb2O55029 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Copb2O55029 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Copb2O55029 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Copb2O55029 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Copb2O55029 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Copb2O55029 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Copb2O55029 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Copb2O55029 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Copb2O55029 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Copb2O55029 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Copb2O55029 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Copb2O55029 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Copb2O55029 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Copb2O55029 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Copb2O55029 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Copb2O55029 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Copb2O55029 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Copb2O55029 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Copb2O55029 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Copb2O55029 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Copb2O55029 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Copb2O55029 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Copb2O55029 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Copb2O55029 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Copb2O55029 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Copb2O55029 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Copb2O55029 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Copb2O55029 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Copb2O55029 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Copb2O55029 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Copb2O55029 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Copb2O55029 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Copb2O55029 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Copb2O55029 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Copb2O55029 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Copb2O55029 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Copb2O55029 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Copb2O55029 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Copb2O55029 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Copb2O55029 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Copb2O55029 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Copb2O55029 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Copb2O55029 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Copb2O55029 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Copb2O55029 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Copb2O55029 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Copb2O55029 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Copb2O55029 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Copb2O55029 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Copb2O55029 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Copb2O55029 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Copb2O55029 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms