Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc3O55013 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc3O55013 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc3O55013 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc3O55013 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc3O55013 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc3O55013 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc3O55013 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc3O55013 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc3O55013 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc3O55013 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc3O55013 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc3O55013 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc3O55013 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc3O55013 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc3O55013 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc3O55013 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc3O55013 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc3O55013 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc3O55013 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc3O55013 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc3O55013 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc3O55013 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc3O55013 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc3O55013 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trappc3O55013 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trappc3O55013 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trappc3O55013 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Trappc3O55013 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trappc3O55013 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trappc3O55013 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trappc3O55013 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trappc3O55013 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc3O55013 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc3O55013 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc3O55013 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc3O55013 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc3O55013 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc3O55013 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc3O55013 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc3O55013 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc3O55013 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc3O55013 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc3O55013 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc3O55013 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc3O55013 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc3O55013 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc3O55013 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc3O55013 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc3O55013 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc3O55013 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc3O55013 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc3O55013 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc3O55013 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc3O55013 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc3O55013 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc3O55013 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc3O55013 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc3O55013 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc3O55013 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc3O55013 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc3O55013 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc3O55013 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc3O55013 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc3O55013 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc3O55013 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc3O55013 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc3O55013 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc3O55013 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc3O55013 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc3O55013 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc3O55013 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc3O55013 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc3O55013 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc3O55013 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc3O55013 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc3O55013 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc3O55013 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc3O55013 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc3O55013 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc3O55013 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc3O55013 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc3O55013 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Trappc3O55013 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc3O55013 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Trappc3O55013 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc3O55013 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc3O55013 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc3O55013 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc3O55013 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc3O55013 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc3O55013 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc3O55013 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc3O55013 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc3O55013 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc3O55013 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc3O55013 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc3O55013 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc3O55013 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc3O55013 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms