Protein–RNA interactions for Protein: O54946

Dnajb6, DnaJ homolog subfamily B member 6, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajb6O54946 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dnajb6O54946 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dnajb6O54946 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dnajb6O54946 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dnajb6O54946 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Dnajb6O54946 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dnajb6O54946 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dnajb6O54946 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dnajb6O54946 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dnajb6O54946 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dnajb6O54946 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dnajb6O54946 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dnajb6O54946 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dnajb6O54946 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dnajb6O54946 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Dnajb6O54946 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dnajb6O54946 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Dnajb6O54946 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dnajb6O54946 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Dnajb6O54946 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dnajb6O54946 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Dnajb6O54946 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dnajb6O54946 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dnajb6O54946 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Dnajb6O54946 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dnajb6O54946 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dnajb6O54946 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dnajb6O54946 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnajb6O54946 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnajb6O54946 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnajb6O54946 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnajb6O54946 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnajb6O54946 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnajb6O54946 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnajb6O54946 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Dnajb6O54946 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnajb6O54946 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnajb6O54946 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnajb6O54946 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnajb6O54946 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Dnajb6O54946 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnajb6O54946 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnajb6O54946 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnajb6O54946 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnajb6O54946 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Dnajb6O54946 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Dnajb6O54946 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnajb6O54946 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnajb6O54946 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnajb6O54946 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnajb6O54946 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnajb6O54946 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Dnajb6O54946 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Dnajb6O54946 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Dnajb6O54946 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnajb6O54946 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnajb6O54946 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Dnajb6O54946 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dnajb6O54946 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dnajb6O54946 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Dnajb6O54946 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dnajb6O54946 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dnajb6O54946 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Dnajb6O54946 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dnajb6O54946 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dnajb6O54946 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Dnajb6O54946 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dnajb6O54946 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dnajb6O54946 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Dnajb6O54946 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dnajb6O54946 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dnajb6O54946 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dnajb6O54946 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dnajb6O54946 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dnajb6O54946 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dnajb6O54946 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dnajb6O54946 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dnajb6O54946 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dnajb6O54946 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dnajb6O54946 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dnajb6O54946 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dnajb6O54946 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnajb6O54946 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnajb6O54946 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnajb6O54946 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnajb6O54946 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnajb6O54946 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnajb6O54946 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnajb6O54946 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnajb6O54946 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnajb6O54946 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnajb6O54946 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnajb6O54946 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dnajb6O54946 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dnajb6O54946 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dnajb6O54946 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dnajb6O54946 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dnajb6O54946 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dnajb6O54946 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dnajb6O54946 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms