Protein–RNA interactions for Protein: O54941

Smarce1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarce1O54941 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smarce1O54941 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smarce1O54941 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smarce1O54941 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smarce1O54941 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smarce1O54941 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smarce1O54941 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Smarce1O54941 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smarce1O54941 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smarce1O54941 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smarce1O54941 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smarce1O54941 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smarce1O54941 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smarce1O54941 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smarce1O54941 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smarce1O54941 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smarce1O54941 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smarce1O54941 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Smarce1O54941 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smarce1O54941 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smarce1O54941 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smarce1O54941 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smarce1O54941 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smarce1O54941 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smarce1O54941 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smarce1O54941 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smarce1O54941 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smarce1O54941 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smarce1O54941 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smarce1O54941 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smarce1O54941 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smarce1O54941 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smarce1O54941 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smarce1O54941 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smarce1O54941 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smarce1O54941 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Smarce1O54941 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smarce1O54941 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarce1O54941 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarce1O54941 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarce1O54941 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarce1O54941 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarce1O54941 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarce1O54941 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarce1O54941 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarce1O54941 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarce1O54941 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarce1O54941 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarce1O54941 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarce1O54941 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smarce1O54941 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smarce1O54941 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smarce1O54941 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smarce1O54941 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smarce1O54941 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smarce1O54941 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smarce1O54941 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smarce1O54941 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smarce1O54941 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smarce1O54941 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smarce1O54941 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smarce1O54941 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smarce1O54941 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smarce1O54941 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smarce1O54941 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smarce1O54941 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smarce1O54941 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smarce1O54941 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smarce1O54941 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smarce1O54941 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Smarce1O54941 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smarce1O54941 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smarce1O54941 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Smarce1O54941 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Smarce1O54941 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smarce1O54941 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smarce1O54941 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smarce1O54941 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smarce1O54941 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarce1O54941 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarce1O54941 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarce1O54941 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarce1O54941 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarce1O54941 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarce1O54941 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarce1O54941 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarce1O54941 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarce1O54941 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarce1O54941 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarce1O54941 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarce1O54941 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarce1O54941 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarce1O54941 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarce1O54941 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Smarce1O54941 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Smarce1O54941 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smarce1O54941 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smarce1O54941 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smarce1O54941 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smarce1O54941 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms