Protein–RNA interactions for Protein: O54836

Zmat3, Zinc finger matrin-type protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zmat3O54836 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zmat3O54836 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zmat3O54836 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zmat3O54836 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zmat3O54836 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zmat3O54836 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zmat3O54836 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zmat3O54836 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zmat3O54836 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zmat3O54836 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zmat3O54836 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zmat3O54836 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zmat3O54836 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zmat3O54836 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Zmat3O54836 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zmat3O54836 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zmat3O54836 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zmat3O54836 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zmat3O54836 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zmat3O54836 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zmat3O54836 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zmat3O54836 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zmat3O54836 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zmat3O54836 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Zmat3O54836 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zmat3O54836 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zmat3O54836 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zmat3O54836 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zmat3O54836 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zmat3O54836 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zmat3O54836 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zmat3O54836 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zmat3O54836 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zmat3O54836 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zmat3O54836 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zmat3O54836 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Zmat3O54836 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zmat3O54836 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zmat3O54836 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zmat3O54836 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zmat3O54836 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zmat3O54836 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zmat3O54836 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zmat3O54836 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zmat3O54836 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zmat3O54836 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zmat3O54836 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zmat3O54836 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zmat3O54836 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zmat3O54836 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zmat3O54836 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zmat3O54836 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zmat3O54836 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zmat3O54836 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zmat3O54836 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zmat3O54836 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zmat3O54836 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zmat3O54836 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zmat3O54836 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zmat3O54836 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zmat3O54836 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Zmat3O54836 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zmat3O54836 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zmat3O54836 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zmat3O54836 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zmat3O54836 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zmat3O54836 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zmat3O54836 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zmat3O54836 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zmat3O54836 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zmat3O54836 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zmat3O54836 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zmat3O54836 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zmat3O54836 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zmat3O54836 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zmat3O54836 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zmat3O54836 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zmat3O54836 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zmat3O54836 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zmat3O54836 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zmat3O54836 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zmat3O54836 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zmat3O54836 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zmat3O54836 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zmat3O54836 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zmat3O54836 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zmat3O54836 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zmat3O54836 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zmat3O54836 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zmat3O54836 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zmat3O54836 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zmat3O54836 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zmat3O54836 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zmat3O54836 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zmat3O54836 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zmat3O54836 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zmat3O54836 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zmat3O54836 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zmat3O54836 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zmat3O54836 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms