Protein–RNA interactions for Protein: O54798

Brs3, Bombesin receptor subtype-3, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brs3O54798 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brs3O54798 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brs3O54798 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brs3O54798 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brs3O54798 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brs3O54798 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brs3O54798 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brs3O54798 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brs3O54798 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brs3O54798 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brs3O54798 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brs3O54798 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brs3O54798 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brs3O54798 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brs3O54798 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brs3O54798 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brs3O54798 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brs3O54798 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brs3O54798 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brs3O54798 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brs3O54798 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brs3O54798 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brs3O54798 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brs3O54798 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brs3O54798 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brs3O54798 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brs3O54798 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brs3O54798 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Brs3O54798 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brs3O54798 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brs3O54798 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brs3O54798 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brs3O54798 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brs3O54798 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brs3O54798 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brs3O54798 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brs3O54798 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brs3O54798 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brs3O54798 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brs3O54798 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brs3O54798 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brs3O54798 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brs3O54798 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brs3O54798 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brs3O54798 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brs3O54798 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brs3O54798 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brs3O54798 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brs3O54798 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brs3O54798 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Brs3O54798 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brs3O54798 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brs3O54798 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brs3O54798 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Brs3O54798 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brs3O54798 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brs3O54798 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brs3O54798 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brs3O54798 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brs3O54798 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brs3O54798 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brs3O54798 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brs3O54798 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brs3O54798 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brs3O54798 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brs3O54798 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Brs3O54798 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Brs3O54798 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brs3O54798 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brs3O54798 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brs3O54798 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brs3O54798 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brs3O54798 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brs3O54798 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brs3O54798 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brs3O54798 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brs3O54798 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brs3O54798 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brs3O54798 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brs3O54798 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brs3O54798 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brs3O54798 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brs3O54798 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brs3O54798 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brs3O54798 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brs3O54798 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brs3O54798 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brs3O54798 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brs3O54798 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brs3O54798 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brs3O54798 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brs3O54798 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brs3O54798 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brs3O54798 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brs3O54798 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brs3O54798 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brs3O54798 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brs3O54798 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Brs3O54798 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Brs3O54798 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms