Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DffaO54786 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DffaO54786 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DffaO54786 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DffaO54786 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DffaO54786 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DffaO54786 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DffaO54786 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DffaO54786 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DffaO54786 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DffaO54786 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DffaO54786 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DffaO54786 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DffaO54786 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DffaO54786 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DffaO54786 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
DffaO54786 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DffaO54786 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DffaO54786 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DffaO54786 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DffaO54786 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DffaO54786 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DffaO54786 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DffaO54786 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DffaO54786 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DffaO54786 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DffaO54786 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DffaO54786 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DffaO54786 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DffaO54786 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DffaO54786 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DffaO54786 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DffaO54786 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
DffaO54786 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DffaO54786 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DffaO54786 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DffaO54786 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DffaO54786 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DffaO54786 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DffaO54786 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DffaO54786 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DffaO54786 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DffaO54786 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DffaO54786 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DffaO54786 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DffaO54786 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DffaO54786 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DffaO54786 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DffaO54786 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DffaO54786 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DffaO54786 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
DffaO54786 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DffaO54786 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DffaO54786 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
DffaO54786 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DffaO54786 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
DffaO54786 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DffaO54786 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DffaO54786 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DffaO54786 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
DffaO54786 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DffaO54786 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DffaO54786 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DffaO54786 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DffaO54786 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DffaO54786 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DffaO54786 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DffaO54786 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DffaO54786 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DffaO54786 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DffaO54786 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DffaO54786 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DffaO54786 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DffaO54786 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DffaO54786 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DffaO54786 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DffaO54786 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DffaO54786 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DffaO54786 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DffaO54786 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DffaO54786 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DffaO54786 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DffaO54786 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DffaO54786 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DffaO54786 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DffaO54786 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DffaO54786 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DffaO54786 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DffaO54786 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DffaO54786 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DffaO54786 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DffaO54786 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DffaO54786 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DffaO54786 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DffaO54786 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DffaO54786 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DffaO54786 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DffaO54786 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DffaO54786 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DffaO54786 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
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