Protein–RNA interactions for Protein: O54785

Limk2, LIM domain kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limk2O54785 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Limk2O54785 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Limk2O54785 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Limk2O54785 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Limk2O54785 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Limk2O54785 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Limk2O54785 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Limk2O54785 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Limk2O54785 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Limk2O54785 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Limk2O54785 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Limk2O54785 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Limk2O54785 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Limk2O54785 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Limk2O54785 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Limk2O54785 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Limk2O54785 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Limk2O54785 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Limk2O54785 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Limk2O54785 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Limk2O54785 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Limk2O54785 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Limk2O54785 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Limk2O54785 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Limk2O54785 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Limk2O54785 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Limk2O54785 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Limk2O54785 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Limk2O54785 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Limk2O54785 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Limk2O54785 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Limk2O54785 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Limk2O54785 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Limk2O54785 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Limk2O54785 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Limk2O54785 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Limk2O54785 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Limk2O54785 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Limk2O54785 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Limk2O54785 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Limk2O54785 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Limk2O54785 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Limk2O54785 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Limk2O54785 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Limk2O54785 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Limk2O54785 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Limk2O54785 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Limk2O54785 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Limk2O54785 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Limk2O54785 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Limk2O54785 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Limk2O54785 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Limk2O54785 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Limk2O54785 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Limk2O54785 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Limk2O54785 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Limk2O54785 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Limk2O54785 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Limk2O54785 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Limk2O54785 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Limk2O54785 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Limk2O54785 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Limk2O54785 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Limk2O54785 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Limk2O54785 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Limk2O54785 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Limk2O54785 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Limk2O54785 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Limk2O54785 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Limk2O54785 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Limk2O54785 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Limk2O54785 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Limk2O54785 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Limk2O54785 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Limk2O54785 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Limk2O54785 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Limk2O54785 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Limk2O54785 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Limk2O54785 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Limk2O54785 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Limk2O54785 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Limk2O54785 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Limk2O54785 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Limk2O54785 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Limk2O54785 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Limk2O54785 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Limk2O54785 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Limk2O54785 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Limk2O54785 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Limk2O54785 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Limk2O54785 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Limk2O54785 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Limk2O54785 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Limk2O54785 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Limk2O54785 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Limk2O54785 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Limk2O54785 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Limk2O54785 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Limk2O54785 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Limk2O54785 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms