Protein–RNA interactions for Protein: O54689

Ccr6, C-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr6O54689 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccr6O54689 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccr6O54689 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccr6O54689 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccr6O54689 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccr6O54689 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccr6O54689 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccr6O54689 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccr6O54689 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccr6O54689 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccr6O54689 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccr6O54689 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccr6O54689 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccr6O54689 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccr6O54689 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccr6O54689 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccr6O54689 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccr6O54689 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccr6O54689 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccr6O54689 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccr6O54689 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccr6O54689 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccr6O54689 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccr6O54689 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccr6O54689 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccr6O54689 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccr6O54689 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccr6O54689 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccr6O54689 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccr6O54689 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccr6O54689 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccr6O54689 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccr6O54689 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccr6O54689 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccr6O54689 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccr6O54689 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccr6O54689 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccr6O54689 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccr6O54689 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccr6O54689 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccr6O54689 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccr6O54689 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccr6O54689 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccr6O54689 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccr6O54689 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccr6O54689 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccr6O54689 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccr6O54689 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccr6O54689 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccr6O54689 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccr6O54689 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccr6O54689 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccr6O54689 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccr6O54689 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccr6O54689 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccr6O54689 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccr6O54689 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccr6O54689 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccr6O54689 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccr6O54689 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccr6O54689 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccr6O54689 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccr6O54689 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccr6O54689 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccr6O54689 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccr6O54689 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccr6O54689 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccr6O54689 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccr6O54689 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccr6O54689 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccr6O54689 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccr6O54689 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccr6O54689 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccr6O54689 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccr6O54689 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccr6O54689 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccr6O54689 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccr6O54689 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccr6O54689 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccr6O54689 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccr6O54689 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccr6O54689 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccr6O54689 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccr6O54689 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccr6O54689 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccr6O54689 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccr6O54689 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccr6O54689 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccr6O54689 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccr6O54689 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccr6O54689 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccr6O54689 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccr6O54689 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccr6O54689 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccr6O54689 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccr6O54689 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccr6O54689 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccr6O54689 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccr6O54689 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccr6O54689 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms