Protein–RNA interactions for Protein: O35926

Cdk5r2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5r2O35926 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdk5r2O35926 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdk5r2O35926 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdk5r2O35926 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdk5r2O35926 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdk5r2O35926 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdk5r2O35926 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdk5r2O35926 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdk5r2O35926 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdk5r2O35926 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdk5r2O35926 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdk5r2O35926 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdk5r2O35926 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdk5r2O35926 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdk5r2O35926 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdk5r2O35926 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdk5r2O35926 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdk5r2O35926 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdk5r2O35926 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdk5r2O35926 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdk5r2O35926 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdk5r2O35926 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdk5r2O35926 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdk5r2O35926 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdk5r2O35926 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdk5r2O35926 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdk5r2O35926 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdk5r2O35926 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdk5r2O35926 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdk5r2O35926 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdk5r2O35926 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdk5r2O35926 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdk5r2O35926 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdk5r2O35926 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdk5r2O35926 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdk5r2O35926 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdk5r2O35926 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdk5r2O35926 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdk5r2O35926 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdk5r2O35926 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdk5r2O35926 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdk5r2O35926 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdk5r2O35926 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdk5r2O35926 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdk5r2O35926 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdk5r2O35926 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdk5r2O35926 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdk5r2O35926 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Cdk5r2O35926 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdk5r2O35926 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdk5r2O35926 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdk5r2O35926 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdk5r2O35926 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdk5r2O35926 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdk5r2O35926 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdk5r2O35926 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdk5r2O35926 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdk5r2O35926 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdk5r2O35926 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdk5r2O35926 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdk5r2O35926 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdk5r2O35926 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdk5r2O35926 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdk5r2O35926 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdk5r2O35926 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdk5r2O35926 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdk5r2O35926 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdk5r2O35926 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdk5r2O35926 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdk5r2O35926 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdk5r2O35926 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdk5r2O35926 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdk5r2O35926 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdk5r2O35926 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdk5r2O35926 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdk5r2O35926 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdk5r2O35926 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdk5r2O35926 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdk5r2O35926 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdk5r2O35926 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdk5r2O35926 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdk5r2O35926 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdk5r2O35926 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdk5r2O35926 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdk5r2O35926 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdk5r2O35926 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdk5r2O35926 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdk5r2O35926 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdk5r2O35926 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdk5r2O35926 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdk5r2O35926 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdk5r2O35926 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdk5r2O35926 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdk5r2O35926 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdk5r2O35926 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdk5r2O35926 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdk5r2O35926 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdk5r2O35926 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdk5r2O35926 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdk5r2O35926 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms