Protein–RNA interactions for Protein: O35885

Ascl2, Achaete-scute homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl2O35885 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ascl2O35885 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ascl2O35885 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ascl2O35885 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ascl2O35885 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ascl2O35885 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ascl2O35885 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ascl2O35885 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ascl2O35885 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ascl2O35885 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ascl2O35885 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ascl2O35885 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ascl2O35885 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ascl2O35885 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ascl2O35885 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ascl2O35885 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ascl2O35885 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ascl2O35885 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ascl2O35885 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ascl2O35885 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ascl2O35885 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ascl2O35885 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ascl2O35885 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ascl2O35885 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ascl2O35885 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ascl2O35885 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ascl2O35885 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ascl2O35885 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ascl2O35885 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ascl2O35885 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ascl2O35885 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ascl2O35885 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ascl2O35885 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ascl2O35885 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ascl2O35885 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ascl2O35885 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ascl2O35885 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ascl2O35885 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ascl2O35885 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ascl2O35885 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ascl2O35885 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ascl2O35885 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ascl2O35885 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ascl2O35885 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ascl2O35885 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ascl2O35885 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ascl2O35885 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ascl2O35885 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ascl2O35885 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ascl2O35885 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ascl2O35885 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ascl2O35885 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ascl2O35885 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ascl2O35885 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ascl2O35885 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ascl2O35885 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ascl2O35885 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ascl2O35885 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ascl2O35885 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ascl2O35885 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ascl2O35885 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ascl2O35885 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ascl2O35885 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ascl2O35885 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ascl2O35885 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ascl2O35885 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ascl2O35885 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ascl2O35885 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ascl2O35885 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ascl2O35885 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ascl2O35885 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ascl2O35885 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ascl2O35885 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ascl2O35885 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ascl2O35885 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ascl2O35885 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ascl2O35885 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ascl2O35885 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ascl2O35885 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ascl2O35885 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ascl2O35885 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ascl2O35885 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ascl2O35885 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ascl2O35885 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ascl2O35885 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ascl2O35885 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ascl2O35885 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ascl2O35885 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ascl2O35885 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ascl2O35885 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ascl2O35885 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ascl2O35885 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ascl2O35885 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ascl2O35885 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ascl2O35885 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ascl2O35885 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ascl2O35885 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ascl2O35885 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ascl2O35885 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ascl2O35885 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms