Protein–RNA interactions for Protein: O35516

Notch2, Neurogenic locus notch homolog protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Notch2O35516 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Notch2O35516 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Notch2O35516 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Notch2O35516 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Notch2O35516 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Notch2O35516 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Notch2O35516 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Notch2O35516 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Notch2O35516 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Notch2O35516 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Notch2O35516 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Notch2O35516 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Notch2O35516 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Notch2O35516 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Notch2O35516 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Notch2O35516 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Notch2O35516 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Notch2O35516 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Notch2O35516 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Notch2O35516 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Notch2O35516 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Notch2O35516 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Notch2O35516 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Notch2O35516 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Notch2O35516 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Notch2O35516 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Notch2O35516 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Notch2O35516 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Notch2O35516 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Notch2O35516 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Notch2O35516 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Notch2O35516 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Notch2O35516 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Notch2O35516 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Notch2O35516 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Notch2O35516 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Notch2O35516 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Notch2O35516 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Notch2O35516 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Notch2O35516 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Notch2O35516 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Notch2O35516 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Notch2O35516 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Notch2O35516 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Notch2O35516 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Notch2O35516 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Notch2O35516 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Notch2O35516 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Notch2O35516 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Notch2O35516 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Notch2O35516 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Notch2O35516 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Notch2O35516 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Notch2O35516 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Notch2O35516 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Notch2O35516 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Notch2O35516 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Notch2O35516 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Notch2O35516 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Notch2O35516 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Notch2O35516 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Notch2O35516 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Notch2O35516 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Notch2O35516 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Notch2O35516 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Notch2O35516 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Notch2O35516 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Notch2O35516 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Notch2O35516 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Notch2O35516 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Notch2O35516 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Notch2O35516 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Notch2O35516 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Notch2O35516 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Notch2O35516 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Notch2O35516 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Notch2O35516 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Notch2O35516 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Notch2O35516 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Notch2O35516 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Notch2O35516 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Notch2O35516 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Notch2O35516 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Notch2O35516 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Notch2O35516 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Notch2O35516 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Notch2O35516 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Notch2O35516 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Notch2O35516 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Notch2O35516 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Notch2O35516 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Notch2O35516 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Notch2O35516 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Notch2O35516 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Notch2O35516 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Notch2O35516 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Notch2O35516 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Notch2O35516 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Notch2O35516 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Notch2O35516 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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