Protein–RNA interactions for Protein: O35464

Sema6a, Semaphorin-6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6aO35464 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sema6aO35464 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sema6aO35464 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sema6aO35464 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sema6aO35464 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sema6aO35464 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sema6aO35464 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sema6aO35464 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sema6aO35464 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sema6aO35464 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sema6aO35464 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sema6aO35464 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sema6aO35464 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sema6aO35464 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sema6aO35464 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sema6aO35464 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Sema6aO35464 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Sema6aO35464 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sema6aO35464 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sema6aO35464 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sema6aO35464 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sema6aO35464 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sema6aO35464 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sema6aO35464 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sema6aO35464 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sema6aO35464 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sema6aO35464 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sema6aO35464 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sema6aO35464 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sema6aO35464 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sema6aO35464 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sema6aO35464 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sema6aO35464 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sema6aO35464 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sema6aO35464 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sema6aO35464 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sema6aO35464 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sema6aO35464 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sema6aO35464 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sema6aO35464 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sema6aO35464 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sema6aO35464 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sema6aO35464 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sema6aO35464 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sema6aO35464 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sema6aO35464 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sema6aO35464 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sema6aO35464 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sema6aO35464 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sema6aO35464 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sema6aO35464 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sema6aO35464 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sema6aO35464 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sema6aO35464 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sema6aO35464 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sema6aO35464 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sema6aO35464 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sema6aO35464 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sema6aO35464 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sema6aO35464 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sema6aO35464 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sema6aO35464 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sema6aO35464 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sema6aO35464 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sema6aO35464 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sema6aO35464 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sema6aO35464 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Sema6aO35464 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Sema6aO35464 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sema6aO35464 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sema6aO35464 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sema6aO35464 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sema6aO35464 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sema6aO35464 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sema6aO35464 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sema6aO35464 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sema6aO35464 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sema6aO35464 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sema6aO35464 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sema6aO35464 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sema6aO35464 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sema6aO35464 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sema6aO35464 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sema6aO35464 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sema6aO35464 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sema6aO35464 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sema6aO35464 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sema6aO35464 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sema6aO35464 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sema6aO35464 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sema6aO35464 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema6aO35464 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema6aO35464 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema6aO35464 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema6aO35464 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema6aO35464 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema6aO35464 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema6aO35464 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema6aO35464 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema6aO35464 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.4 ms