Protein–RNA interactions for Protein: O35427

Crcp, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC9, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrcpO35427 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CrcpO35427 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CrcpO35427 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CrcpO35427 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CrcpO35427 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CrcpO35427 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CrcpO35427 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CrcpO35427 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CrcpO35427 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CrcpO35427 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CrcpO35427 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CrcpO35427 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CrcpO35427 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CrcpO35427 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CrcpO35427 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CrcpO35427 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CrcpO35427 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CrcpO35427 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CrcpO35427 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CrcpO35427 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CrcpO35427 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CrcpO35427 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CrcpO35427 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CrcpO35427 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CrcpO35427 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CrcpO35427 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CrcpO35427 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CrcpO35427 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CrcpO35427 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CrcpO35427 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CrcpO35427 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CrcpO35427 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CrcpO35427 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CrcpO35427 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CrcpO35427 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CrcpO35427 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CrcpO35427 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CrcpO35427 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CrcpO35427 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CrcpO35427 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CrcpO35427 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CrcpO35427 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CrcpO35427 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CrcpO35427 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CrcpO35427 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CrcpO35427 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CrcpO35427 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CrcpO35427 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CrcpO35427 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CrcpO35427 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CrcpO35427 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CrcpO35427 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CrcpO35427 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CrcpO35427 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CrcpO35427 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CrcpO35427 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CrcpO35427 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CrcpO35427 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CrcpO35427 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CrcpO35427 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CrcpO35427 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CrcpO35427 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CrcpO35427 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CrcpO35427 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CrcpO35427 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CrcpO35427 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CrcpO35427 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CrcpO35427 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CrcpO35427 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CrcpO35427 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CrcpO35427 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CrcpO35427 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CrcpO35427 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CrcpO35427 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CrcpO35427 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CrcpO35427 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CrcpO35427 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CrcpO35427 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CrcpO35427 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CrcpO35427 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CrcpO35427 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CrcpO35427 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CrcpO35427 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CrcpO35427 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CrcpO35427 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CrcpO35427 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CrcpO35427 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CrcpO35427 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CrcpO35427 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CrcpO35427 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CrcpO35427 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CrcpO35427 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CrcpO35427 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CrcpO35427 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CrcpO35427 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CrcpO35427 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CrcpO35427 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CrcpO35427 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CrcpO35427 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CrcpO35427 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms