Protein–RNA interactions for Protein: O35304

Slc18a3, Vesicular acetylcholine transporter, mousemouse

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Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18a3O35304 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc18a3O35304 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc18a3O35304 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Slc18a3O35304 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc18a3O35304 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Slc18a3O35304 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc18a3O35304 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc18a3O35304 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc18a3O35304 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc18a3O35304 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc18a3O35304 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Slc18a3O35304 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc18a3O35304 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc18a3O35304 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc18a3O35304 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc18a3O35304 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc18a3O35304 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Slc18a3O35304 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc18a3O35304 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc18a3O35304 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Slc18a3O35304 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Slc18a3O35304 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Slc18a3O35304 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Slc18a3O35304 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc18a3O35304 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc18a3O35304 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc18a3O35304 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Slc18a3O35304 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Slc18a3O35304 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Slc18a3O35304 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Slc18a3O35304 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Slc18a3O35304 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc18a3O35304 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc18a3O35304 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc18a3O35304 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc18a3O35304 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc18a3O35304 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc18a3O35304 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc18a3O35304 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc18a3O35304 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc18a3O35304 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc18a3O35304 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc18a3O35304 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc18a3O35304 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc18a3O35304 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc18a3O35304 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc18a3O35304 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc18a3O35304 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Slc18a3O35304 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.8 ms