Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nedd9O35177 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nedd9O35177 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nedd9O35177 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nedd9O35177 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nedd9O35177 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nedd9O35177 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nedd9O35177 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nedd9O35177 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nedd9O35177 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nedd9O35177 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nedd9O35177 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nedd9O35177 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nedd9O35177 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nedd9O35177 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nedd9O35177 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nedd9O35177 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nedd9O35177 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nedd9O35177 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Nedd9O35177 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Nedd9O35177 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nedd9O35177 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nedd9O35177 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nedd9O35177 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nedd9O35177 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nedd9O35177 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nedd9O35177 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nedd9O35177 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nedd9O35177 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nedd9O35177 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nedd9O35177 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nedd9O35177 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nedd9O35177 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Nedd9O35177 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nedd9O35177 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nedd9O35177 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
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Nedd9O35177 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nedd9O35177 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nedd9O35177 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nedd9O35177 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nedd9O35177 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
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Nedd9O35177 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
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Nedd9O35177 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nedd9O35177 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
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Nedd9O35177 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nedd9O35177 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nedd9O35177 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
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Nedd9O35177 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nedd9O35177 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nedd9O35177 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nedd9O35177 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nedd9O35177 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nedd9O35177 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
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Nedd9O35177 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
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Nedd9O35177 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
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Nedd9O35177 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nedd9O35177 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nedd9O35177 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nedd9O35177 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nedd9O35177 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nedd9O35177 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
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Nedd9O35177 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nedd9O35177 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nedd9O35177 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nedd9O35177 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nedd9O35177 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nedd9O35177 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nedd9O35177 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nedd9O35177 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nedd9O35177 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nedd9O35177 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nedd9O35177 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nedd9O35177 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nedd9O35177 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nedd9O35177 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nedd9O35177 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nedd9O35177 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
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