Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pitx3O35160 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pitx3O35160 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pitx3O35160 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pitx3O35160 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pitx3O35160 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pitx3O35160 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pitx3O35160 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pitx3O35160 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pitx3O35160 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pitx3O35160 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pitx3O35160 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pitx3O35160 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pitx3O35160 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pitx3O35160 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pitx3O35160 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pitx3O35160 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pitx3O35160 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pitx3O35160 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pitx3O35160 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pitx3O35160 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pitx3O35160 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pitx3O35160 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pitx3O35160 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pitx3O35160 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pitx3O35160 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pitx3O35160 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitx3O35160 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitx3O35160 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitx3O35160 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitx3O35160 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitx3O35160 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitx3O35160 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitx3O35160 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitx3O35160 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitx3O35160 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitx3O35160 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitx3O35160 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitx3O35160 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitx3O35160 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitx3O35160 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitx3O35160 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitx3O35160 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitx3O35160 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pitx3O35160 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pitx3O35160 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pitx3O35160 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pitx3O35160 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pitx3O35160 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pitx3O35160 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pitx3O35160 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pitx3O35160 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pitx3O35160 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pitx3O35160 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pitx3O35160 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pitx3O35160 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pitx3O35160 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pitx3O35160 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pitx3O35160 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pitx3O35160 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pitx3O35160 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pitx3O35160 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pitx3O35160 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pitx3O35160 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pitx3O35160 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pitx3O35160 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pitx3O35160 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pitx3O35160 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pitx3O35160 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pitx3O35160 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pitx3O35160 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pitx3O35160 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pitx3O35160 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pitx3O35160 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pitx3O35160 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pitx3O35160 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pitx3O35160 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pitx3O35160 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pitx3O35160 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitx3O35160 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitx3O35160 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitx3O35160 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitx3O35160 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitx3O35160 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitx3O35160 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitx3O35160 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitx3O35160 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitx3O35160 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitx3O35160 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitx3O35160 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitx3O35160 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitx3O35160 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitx3O35160 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitx3O35160 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitx3O35160 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitx3O35160 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitx3O35160 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pitx3O35160 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pitx3O35160 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pitx3O35160 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms