Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
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Cldn4O35054 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cldn4O35054 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cldn4O35054 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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Cldn4O35054 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cldn4O35054 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cldn4O35054 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Cldn4O35054 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cldn4O35054 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Cldn4O35054 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Cldn4O35054 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cldn4O35054 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Cldn4O35054 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cldn4O35054 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cldn4O35054 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cldn4O35054 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Cldn4O35054 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cldn4O35054 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Cldn4O35054 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cldn4O35054 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cldn4O35054 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cldn4O35054 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Cldn4O35054 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cldn4O35054 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cldn4O35054 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Cldn4O35054 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cldn4O35054 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cldn4O35054 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cldn4O35054 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Cldn4O35054 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cldn4O35054 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cldn4O35054 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cldn4O35054 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Cldn4O35054 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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Cldn4O35054 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cldn4O35054 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cldn4O35054 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cldn4O35054 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cldn4O35054 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cldn4O35054 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cldn4O35054 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cldn4O35054 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cldn4O35054 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cldn4O35054 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cldn4O35054 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cldn4O35054 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cldn4O35054 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cldn4O35054 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cldn4O35054 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cldn4O35054 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cldn4O35054 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cldn4O35054 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cldn4O35054 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cldn4O35054 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cldn4O35054 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cldn4O35054 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Cldn4O35054 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cldn4O35054 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cldn4O35054 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cldn4O35054 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cldn4O35054 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms